Відео відсутнє
З пропащею майора Мотоко Кусанагі, Бато з відділу 9 отримує завдання розслідувати низку жахливих убивств — схоже, здійснених зломаними гінойдами, або секс-роботами. Але коли один з таких гінойд залишає Бато криптичне повідомлення, він починає ставити під сумнів причини їхніх збоїв. Підозри у політично мотивованих вбивствах та незаконному "привиді" швидко з'являються, втягуючи Бато та його партнера Тогузу у небезпечну павутину змови. У міру розвитку розслідування межа між людиною та машиною продовжує стиратися, а реальність і сприйняття стають невідмінними. Зіткнувшись зі дивними та небезпечними ворогами, Бато та Тогуса досліджують футуристичний світ, наповнений машинами та живими ляльками, але абсолютно позбавлений людяності.
Замість того, щоб безпосередньо адаптувати вихідний матеріал, як це було у попередньому фільмі, «Привид у оболонці 2: Невинність» базується на ідеї, присутній в одному з підсюжетів оригінального манги. Разом із фільмом було опубліковано книгу, яка слугувала приквелом до «Невинності» і називалася «Після довгого прощання». «Привид у оболонці 2: Невинність» був номінований на Золоту пальмову гілку на Каннському кінофестивалі в 2004 році і досі є єдиним аніме, яке було номіноване на цю престижну нагороду. Фільм здобув нагороду за найкращий анімаційний фільм на 9-х преміях Animation Kobe в 2004 році.