Ґодзабуро був оригінальним засновником і генеральним директором компанії Kaiba Corporation, яка в той час була успішним виробником зброї. Він також був всесвітньо відомим чемпіоном з шахів, саме так Сето і Мокуба дізналися про нього в своєму притулку. Коли Ґодзабуро завітав, Сето викликав його на партію в шахи, сказавши Ґодзабуро, що якщо він відмовиться, то розповість пресі, що той боїться маленької дитини. Ґодзабуро, впевнений, що не програє дитині, погодився на одну гру, з умовою, що якщо Сето виграє, Ґодзабуро погодиться усиновити його та його брата. У манзі Сето обманув. В аніме Сето провів час, вивчаючи стратегії Ґодзабуро і те, як їх подолати, і таким чином переміг його. Ґодзабуро мав дотриматися своєї обіцянки.
Однак він був жорстоким батьком для Сето, змушуючи його витрачати весь свій час на навчання, позбавляючи будь-якої радості або задоволення, зазвичай пов’язаних із дитинством. У цей момент помер і його рідний син Ноа. З його запланованим спадкоємцем Kaiba Corp, оцифрованим, Ґодзабуро вирішив виховати Сето як свого спадкоємця, тиснучи на нього ще більше. Його фатальною помилкою стало те, що він дав Сето 2% акцій Kaiba Corp в рамках місії заробити 100 разів більше протягом року — з чим Сето впорався легко. Пізніше Сето разом з радою директорів, відомою як Велика п’ятірка, купує 49% компанії. Ґодзабуро, також володіючи 49%, був викинутий з влади Сето, який володів 51%. повідомляється, що він вчинив самогубство, стрибнувши з верхнього поверху будівлі корпорації Kaiba. (в англійському аніме стверджується, що він втік і зник.)
У японських версіях Ґодзабуро озвучений Уншо Ісідзукою в першій серії та Тецуо Комурою в другій серії. У англійському дубляжі другої серії його озвучує Девід Вілліс.