Сирота в молодому віці, Наото була знайдена в стані амнезії після дуже жорстокого вбивства її батьків, що також призвело до появи знакового шраму у формі X посередині її грудей. Її взяли під опіку, виховали та навчали мечника, якого вона вважала вбивцею своїх батьків. Він назвав її Наото на честь когось зі свого минулого, але ніколи не розкривав їй своє ім'я. Після його наступного вбивства вона дізналася, що її батьків вбив Assassin, на честь якого її й назвали; оригінальний Наото. Після його смерті вона дізналася ім'я свого наставника, Фуюміне, і прийняла його як своє прізвище. Схоже, що після років, проведених з Фуюміне, вона розвинула до нього певні почуття та навіть називає його "батьком" після його смерті. Відтоді Наото подружилася з Нілл і стежила за Хайне в спробах дізнатися більше про історію Фуюміне, першого Наото, і помститися. Вона б'ється з катаною, яку успадкувала від Фуюміне. З-поміж головної групи, до якої входять вона, Бадо і Хайне, вона здається найм'якшою і найменш схильною вбивати.
Вона не зовсім ладить із Хайне, і більшу частину часу, проведеного разом поза боями, вони проводять, злісно пильно дивлячись одне на одного. Імовірно, це пов'язано з тим, що Хайне використовує надзвичайно жорстокі та жорстокі тактики під час боїв. Часто Бадо доводиться знімати напругу між ними. Проте під час зіткнень з ворогами і Наото, і Хайне виявляють велику ефективність, працюючи разом.