Квазіорганічна програма майстер-контролю для корабля Мідзухо. Повністю здатна до самовідновлення та не потребує обслуговування. Летить навколо на надувному колі і час від часу грає на мініатюрній гітарі. Через те, що Кей страхом вдарив «нього» під час первинної спроби втечі, коли Мідзухо відкрила свою справжню особистість, програмування Марі стало сплутаним, що поставило під загрозу як Кей, так і Мідзухо. Спілкуючись частково через нечіткі звуки і жести, Марі по суті є портативним зв'язком з операційною системою корабля. Але «він» також здатен до емоцій, що видно з романтичних стосунків, які склалися між «ним» і Міруру, а також з його смутку через розлуку. Крім того, в OVA натякається на їх секс, і обидва тому стидаються, коли бачать, як інші виявляють ніжність. Натомість в «додаткових» матеріалах серіалу натякається, що Марі і Міруру є лише розширеннями самих кораблів, і отже, є самими кораблями.