Іорі Кітахара переїжджає до прибережного міста Ідзу на свій перший курс університету, поселившись над магазином підводного спорядження свого дядька Grand Blue. Іорі сподівається на ідеальний університетський досвід, але, зайшовши в магазин, він опиняється втягнутим у алкогольні веселощі безтурботних членів дайвінг-клубу, які часто тут бувають. Під впливом старшокурсників Шіндзі Токіти і Рюджіро Котобукі Іорі неохоче приєднується до їхньої дивакуватої тусовки. Згодом його двоюрідна сестра Чіса Котегава заходить і застібає його на гарячому, викликаючи її повне відторгнення. На основі популярної комедійної манги Кендзі Іноуе та Кімітаке Йошіоки, Grand Blue розповідає про пригоди Іорі з його ексцентричними новими друзями, які допомагають йому здійснити мрію про ідеальний університетський досвід та навчитися займатися підводним плаванням.