Відео відсутнє
Мікото Місака та її друзі повертаються, розслідуючи чутки по Академічному Місту. Незабаром Мікото виявляє щось жахливе: у місті відбуваються жахливі експерименти, пов'язані з масовим вбивством тисяч есперів. Більш того, ці еспери далекі від звичайних людей: це клони самої Мікото. Відчуваючи відповідальність за їхнє ставлення, вона вирушає покласти край експериментам; однак сили, які протистоять їй, набагато небезпечніші, ніж вона очікувала, і Мікото стає обличчям до обличчя з деякими з найпотужніших есперів, які тільки можна уявити. Toaru Kagaku no Railgun S продовжує історію Рейлгуну, оскільки вона вкрай намагається покласти край нелюдським експериментам, які, як вона вважає, сама ж сприяла, її життя занурюється в відчай у цьому процесі. В Академічному Місті ніколи не буває нудних моментів, але ніхто ніколи не говорив, що всі вони будуть приємними.